In Gene Troopers speel je een soldaat die in het ‘Gene Troopers’ programma wordt gezet. Dit programma waarbij de soldaat een genetisch transformatieproces doorgaat houdt in dat de soldaat zo wordt aangepast dat hij uiteindelijk een grote, brede, sterke en vooral lelijke supersoldaat wordt. Jij krijgt echter de kans om te ontsnappen, je moet echter wel het transformatie proces dat al is begonnen proberen stop te zetten. Dit alles in buitenaardse omgevingen en terwijl je dwars wordt gezeten door monsters en andere karakters betrokken bij het ‘Gene Trooper’ experiment.
Om dit te bewerkstellingen zal je levels op vele planeten moeten afreizen en uiteraard vele vijanden aan gort moeten schieten. Gedurende het spel zul je teamgenoten oppikken die allemaal hun eigen expertise hebben. Zo hebben we Keisha, een kunstzinnige meid, Trigger, een brute beul die veel kracht heeft en een karakter dat behoort tot een buitenaards insectenras, waarvan de krachten nog niet bekend zijn. Zoals al eerder vermeld zal het spel online speelbaar zijn op Xbox Live, wat het als Xbox spel meteen al een stuk aantrekkelijker maakt.
