In de wereld van Shadowrun is de eeuwenoude mystieke magie weer teruggekeerd naar de wereld. Na 5000 jaar van afwezigheid heeft een groep genaamd de ‘Lineage’ magie weer onder controle en gebruikt het naar eigen inzicht voor het beteren van de mensheid. Samen met deze herontdekte magische krachten steken ook nieuwe rassen weer de kop op in de wereld. Deze magie is natuurlijk zeer interessant voor megabedrijven en het duurt dan ook niet lang voordat een bedrijf genaamd RNA op jacht gaat naar de Lineage, en het geheim achter de magie. Naar eigenzeggen om de orde in de wereld te herstellen maar uiteraard ook voor de nodige winst voor het bedrijf. Het is de Lineage zijn taak om de magie te beschermen en te voorkomen dat deze in handen valt van de gierige megacorporatie.
Het spel wordt een eerste persoons shooter die uitsluitend online of offline tegen de computer of andere spelers kan worden gespeeld. Dankzij een sterke kunstmatige intelligentie van de tegenstanders en een unieke balans tussen de verschillende eigenschappen van de vier speelbare rassen; elven, mensen, trollen en dwergen, moet Shadowrun een unieke ervaring worden. Zo kunnen de mensen van de RNA met hun geavanceerde technieken door muren kijken en valse hologrammen neerzetten om hun vijanden te bedotten terwijl de Lineage weer gebruik kan maken van diverse magische krachten die hen door muren laten lopen of bescherming geven. Ander frappant feit is dat het spel zowel op Windows Vista als op de Xbox 360 uit zal komen en de twee platformen tegen elkaar zullen kunnen spelen.