Prototype wordt een derde persoons actietitel in een open spelwereld waarin de speler midden in een wereld van samenzweringen, misleiding, dodelijke overheidsbureaus, een rijke verhaallijn en de mogelijkheid van vorm te veranderen. Als Alex Mercer, een man achtervolgt door zijn verleden, zul je een geheime oorlog vechten in New York City. Wanneer de actie onhoudbaar wordt en de samenzwering die te maken heeft met jouw ontstaan de toekomst van de mensheid zelf begint te bedreigen zul je de vaardigheden die je hebt moeten gebruiken om een eind te maken aan deze dreiging. Jij kunt met verbazingwekkende ‘shape-shifting’ krachten een exacte replica worden van andere karakters die je tegenkomt en hun uiterlijk, krachten en eigenschappen overnemen.
Het spel zal bijzonder veel leunen op vrijheid van beweging en je zult als krachtig ‘Prototype’ van een nieuwe soort mens 30 verdiepingen hoog kunnen springen en elk mogelijke oppervlakte kunnen beklimmen. Ook zal alles dat je in de weg staat te vernietigen zijn met de ongekende macht om je lichaam te vormen tot vernietigende wapens. Met een nagebouwde versie van New York tot je beschikking om te ontkomen aan de agentschappen die jou zoeken en wereld bedreigen, heb je de complete vrijheid. Maar is die vrijheid genoeg om uit de klauwen van de slechteriken te blijven en de wereld te redden?
