In Rainbow Six 3: Black Arrow worden naast een nieuwe single-player campagne een aantal verse multiplayer modi toegevoegd. In de single-player campagne worden een aantal wetenschappers op het gebied van rakettechnologie ontvoerd, en er ontpopt zich een complot waarin een aantal corrupte legerleiders een conflict in het olierijke Zwarte Zee gebied beginnen om met een leger een invasie uit te kunnen voeren en de macht te grijpen. Niet te ver van de situatie in Irak hedendag? Hoe dan ook de speler wordt ingeschakeld om de boel te redden, zoals gewoonlijk. Nieuwe wapens, nieuwe omgevingen en verbeterde kunstmatige intelligentie voor de vijanden moeten de solocampagne nog beter maken.
Voor de vele multiplayer fans zijn er ook nieuwe spelmodi te vinden in Black Arrow. In 'capture the point' moet de speler een aantal punten overnemen en bezetten, en in de klassieke 'capture the flag' modi moeten spelers de vlag uit het vijandelijke fort halen en naar hun eigen basis terugbrengen. Tijdens je Live games zul je gebruik kunnen maken van de nieuwe 'Tsunami' features die een tijdje geleden aangekondigd zijn. Zo kunnen spelers zelf toernooien in elkaar zetten, berichten sturen naar hun offline vrienden en clanstatistieken bijhouden. Ook kunnen spelers via een geheim planningsmenu hun aanvalstactieken doornemen voor de wedstrijd. Heb je geen Xbox Live? Dan speel je toch coöperatief met je vrienden via split-screen?